Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan5P62080 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms