Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PlnP61014 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PlnP61014 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PlnP61014 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PlnP61014 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PlnP61014 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PlnP61014 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PlnP61014 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PlnP61014 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PlnP61014 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PlnP61014 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PlnP61014 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PlnP61014 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PlnP61014 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PlnP61014 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PlnP61014 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms