Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms