Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms