Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hcls1P49710 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hcls1P49710 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hcls1P49710 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hcls1P49710 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms