Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LtbP41155 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LtbP41155 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LtbP41155 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LtbP41155 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LtbP41155 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LtbP41155 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LtbP41155 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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LtbP41155 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtbP41155 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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