Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ThpoP40226 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms