Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
VtnP29788 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
VtnP29788 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VtnP29788 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VtnP29788 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms