Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NapbP28663 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NapbP28663 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms