Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms