Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P20040 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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