Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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PtpraP18052 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PtpraP18052 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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