Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PolP10400 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms