Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04212 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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