Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-K1P01901 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-K1P01901 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-K1P01901 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-K1P01901 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-K1P01901 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-K1P01901 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms