Protein–RNA interactions for Protein: P01898

H2-Q10, H-2 class I histocompatibility antigen, Q10 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q10P01898 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Q10P01898 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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