Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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