Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfdp1O88271 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms