Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LhbO09108 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LhbO09108 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms