Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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