Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms