Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21310J3QQ23 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms