Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms