Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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