Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Top6blJ3QMY9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top6blJ3QMY9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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