Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm12496-201ENSMUST00000154377 668 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ccnd1-201ENSMUST00000093962 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 BC025920-202ENSMUST00000119492 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Rapgef6-203ENSMUST00000102743 8189 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Olfml2b-201ENSMUST00000046792 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Rnf141-204ENSMUST00000175981 2333 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Pramef12-201ENSMUST00000030326 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Rnf122-201ENSMUST00000046941 3582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Dis3l2-201ENSMUST00000065694 3085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Stam2-201ENSMUST00000102759 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms