Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm8247F6VRJ8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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