Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Ccdc71lE9Q4T4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccdc71lE9Q4T4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccdc71lE9Q4T4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccdc71lE9Q4T4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccdc71lE9Q4T4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms