Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms