Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm3543D3Z235 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm3543D3Z235 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm3543D3Z235 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm3543D3Z235 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm3543D3Z235 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm3543D3Z235 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3543D3Z235 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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