Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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