Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms