Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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