Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518aB2RRF6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518aB2RRF6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518aB2RRF6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518aB2RRF6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518aB2RRF6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518aB2RRF6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518aB2RRF6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms