Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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