Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms