Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms