Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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