Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cldn13Q9Z0S4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cldn13Q9Z0S4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn13Q9Z0S4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn13Q9Z0S4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn13Q9Z0S4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn13Q9Z0S4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn13Q9Z0S4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn13Q9Z0S4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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