Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

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Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ptpn4Q9WU22 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ptpn4Q9WU22 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ptpn4Q9WU22 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ptpn4Q9WU22 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ptpn4Q9WU22 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ptpn4Q9WU22 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ptpn4Q9WU22 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ptpn4Q9WU22 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ptpn4Q9WU22 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ptpn4Q9WU22 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ptpn4Q9WU22 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn4Q9WU22 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms