Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trpc2Q9R244 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trpc2Q9R244 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trpc2Q9R244 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trpc2Q9R244 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trpc2Q9R244 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trpc2Q9R244 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trpc2Q9R244 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trpc2Q9R244 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trpc2Q9R244 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trpc2Q9R244 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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