Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rdh11Q9QYF1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rdh11Q9QYF1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rdh11Q9QYF1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh11Q9QYF1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh11Q9QYF1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh11Q9QYF1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh11Q9QYF1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms