Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn1Q9QXP6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms