Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdcQ9QW08 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdcQ9QW08 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms