Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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