Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms