Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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