Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancaQ9JL70 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FancaQ9JL70 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FancaQ9JL70 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FancaQ9JL70 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FancaQ9JL70 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FancaQ9JL70 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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FancaQ9JL70 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FancaQ9JL70 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FancaQ9JL70 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FancaQ9JL70 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FancaQ9JL70 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FancaQ9JL70 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FancaQ9JL70 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancaQ9JL70 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms