Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms