Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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